Hola. Lamento el fallo. Una posibilidad que he encontrado por ahí es que sea algún bug de Ubiquity, el instalador de Ubuntu.
Has probado a inciarlo en LiveDVD y desde allí ir a Menú > Sistema > Administración > Instalar haciendo la instalación con el Colebuntu funcionando.
Revisa en Menú > Sistema > Administración > Gestor de paquetes de Synaptic que el ubiquity y el ubiquity-frontend-gtk esté en la última versión que creo que ahora es la 2.0.10. Si no, actualízalo antes de hacer la instalación con una copia en USB para hacer las instalaciones.
Al menos, en el foro de remastersys, la herramienta con la que creo la distribución de colebuntu, es por donde apuntan: http://geekconnection.org/remastersys/forums/index.php?topic=522.0 , o aquí apuntan hacia permisos: http://geekconnection.org/remastersys/forums/index.php?topic=510.0 , aunque se me hace raro porque en otras instalaciones no da el problema ¿?.
Ya nos contarás y si es algo de eso actualizaré Colebuntu para solucionarlo en la ISO. Si no es eso no pensaba hacerlo hasta el Ubuntu 10.04.
Un saludo